종양미세환경(TME) 은 암세포뿐만 아니라 다양한 면역 세포, 기질 세포 등이 복잡하게 상호작용하는 생태계이며, 여기서 발생하는 국소적 대사 플럭스 의 변화는 암세포의 증식, 침윤, 그리고 최종적인 세포 운명 결정 에 결정적인 역할을 합니다. 대사체-전사체 통합 모델링…

본 주제는 세포 내 환경, 특히 필수 이온이나 대사체 농도가 극도로 낮은 조건에서 전사 인자가 DNA에 결합하는 전사 개시 복합체(PIC) 의 동역학적 거동을 규명하는 첨단 연구 분야이다. 연구의 주요 쟁점 극저농도 조건에서 발생하는 DNA 초나선 구조 의 국소적 변화…

메타지노믹스 는 환경 샘플 전체의 유전체를 직접 추출하여 분석하는 기술로, 기존의 배양 의존적 접근 방식으로는 규명하기 어려웠던 복잡한 미생물 군집의 기능을 밝히는 데 핵심적인 역할을 합니다. 융합적 해석의 필요성 극한 환경( 열수 분출구, 심해 등) 샘플에서 얻은 거…

생물학 데이터베이스는 생물학적 정보(유전자, 단백질, 종 등)를 체계적으로 저장, 관리 및 검색할 수 있도록 구축된 디지털 시스템이다. 주요 기능 다양한 형태의 생물학적 데이터를 표준화된 방식으로 제공한다. 연구자들이 분자생물학 , 유전체학 , 단백질 구조 등의 정보를…

Gene Ontology (GO)는 생물학적 과정, 분자 기능, 그리고 세포 구성 요소 수준에서 유전자 및 단백질의 기능을 표준화하고 분류하기 위해 개발된 계층적 온톨로지입니다. 핵심 개념 Biological Process (생물학적 과정) : 유기체가 수행하는 광범위…

염색질 구조 는 유전 물질인 DNA 가 세포핵 내에서 어떻게 조직화되고 응축되는지를 나타내는 복잡한 다층적 시스템이다. 염색질의 계층적 구성 가장 기본적인 단위는 뉴클레오솜 이며, 이는 DNA가 히스톤 단백질 주위에 감긴 형태이다. 이 뉴클레오솜들이 더 큰 구조물인 3…

본 프레임워크는 CRISPR 유전자 편집 기술로 편집된 목표 유전자 좌위(locus) 정보를 다양한 Omics 데이터베이스와 융합하여 해당 편집이 유전체 수준에서 야기할 잠재적 기능을 예측하는 계산 생물학적 접근법이다. 데이터 통합 및 예측 편집 대상 부위 주변의 Ch…

Indel Indel 은 DNA 염기서열에서 발생하는 작은 삽입( insertion ) 또는 결실( deletion ) 돌연변이를 총칭하는 용어입니다. 이는 유전자의 코딩 영역 내에서 뉴클레오타이드가 추가되거나 제거되는 현상이며, 종종 유전자 편집 기술 중 하나인 CR…

CRISPR-Cas9 시스템을 이용하여 원하는 유전자를 정밀하게 편집하거나 특정 게놈 위치를 교란할 때, 예기치 않은 광범위한 게놈 재배열 이 발생하는 현상은 현재 많은 난제로 남아 있습니다. 연구상의 주요 쟁점 편집 시 발생하는 Indel 변이뿐만 아니라, 두 개의 …

화석기록 이란 지구 역사 동안 생물체의 흔적(화석)과 그 환경 변화를 기록하는 모든 자료를 포괄하는 개념이다. 주요 구성 요소 생물의 잔해나 변형된 형태인 화석 자체 퇴적암층의 배열 및 지질 구조 정보 고환경학 적 증거들 (예: 미세화석, 동위원소 비율 등) 화석기록 …